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Prediction of signal recognition particle RNA genes : A heuristic method combined with covariance models for prediction of genes that encode SRP RNA - Marco Regalia
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2010, ISBN: 3639229975

[EAN: 9783639229974], Neubuch, [PU: VDM Verlag Dr. Müller], nach der Bestellung gedruckt Neuware - Printed after ordering - We describe a method for prediction of genes that encode SRP RN… Altro …

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2010, ISBN: 9783639229974

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2010

ISBN: 9783639229974

VDM Verlag Dr. Müller, Taschenbuch, 76 Seiten, Publiziert: 2010-01-31T00:00:01Z, Produktgruppe: Buch, Ingenieurwissenschaften, Fachbücher, Kategorien, Bücher, Biotechnologie, Medizin & Ge… Altro …

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2010, ISBN: 9783639229974

VDM Verlag Dr. Müller, Paperback, 76 Seiten, Publiziert: 2010-01-31T00:00:01Z, Produktgruppe: Book, Genetics, Biological Sciences, Science, Nature & Maths, Subjects, Books, Popular Scienc… Altro …

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Dati bibliografici del miglior libro corrispondente

Dettagli del libro
Prediction of signal recognition particle RNA genes: A heuristic method combined with covariance models for prediction of genes that encode SRP RNA
Autore:
Titolo:
ISBN:

3639229975


We describe a method for prediction of genes that encode SRP RNA. A heuristic search for the strongly conserved helix 8 motif is combined with covariance models that are based on previously known SRP RNA sequences. By screening available genomic sequences, we have identified a large number of novel SRP RNA genes and we can account for at least one gene in every genome that has been completely sequenced. Novel bacterial RNAs include that of Thermotoga maritima that, unlike all other non-gram positive eubacteria, is predicted to have an Alu domain. We have also found the RNAs of Lactococcus lactis and Staphylococcus to have an unusual UGAC tetraloop in helix 8 instead of the normal GNRA sequence. An investigation of yeast RNAs reveals conserved sequence elements of the Alu domain that aid in the analysis of these RNAs. Inspection of the human genome reveals only two likely genes, both on chromosome 14. Our method for prediction of SRP RNA genes is the first convenient tool for this task that demonstrated to be efficient and accurate and it should be therefore helpful in genome annotation.

Informazioni dettagliate del libro - Prediction of signal recognition particle RNA genes: A heuristic method combined with covariance models for prediction of genes that encode SRP RNA


EAN (ISBN-13): 9783639229974
ISBN (ISBN-10): 3639229975
Copertina rigida
Copertina flessibile
Anno di pubblicazione: 2010
Editore: VDM Verlag Dr. Müller

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ISBN/EAN: 3639229975

ISBN - Stili di scrittura alternativi:
3-639-22997-5, 978-3-639-22997-4
Stili di scrittura alternativi e concetti di ricerca simili:
Autore del libro : marco gal, regalia
Titolo del libro: srp, signal, genes, recognition, regalia

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